389 पेपर
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि फंगस ग्नेट *Bradysia coprophila* में, एक मातृ आनुवंशिक लिंग-निर्धारण क्षेत्र मादा प्रजनन रूपाकारों (morphs) को विशिष्ट जीवन इतिहास और जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल में अनुकूलनशील विचलन की ओर प्रेरित करता है, जिससे लैंगिक द्विरूपता और लिंग गुणसूत्र विकास के मूल सिद्धांतों का विस्तार मातृ लिंग-निर्धारण प्रणालियों तक होता है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि बड़े फाइलोगेनी (phylogenies) में अभिसारी विकास (convergent evolution) का विश्लेषण, विशिष्ट रिसेप्टर-बाइंडिंग साइट प्रतिस्थापन (receptor-binding site substitutions) की पहचान करके, जो प्रमुखता से प्रभावी होने से पहले ही सकारात्मक चयन (positive selection) के अधीन होते हैं, एक वर्ष पहले ही H3N2 इन्फ्लुएंजा वायरस में प्रमुख एंटीजेनिक बदलावों (antigenic shifts) की भविष्यवाणी कर सकता है।
यह अध्ययन टैक्सोनोमिक अनिश्चितताओं को सुलझाने, इसके विकास में अपूर्ण वंशावली पृथक्करण (इनकम्प्लीट लीनेज सॉर्टिंग) और संकरण की भूमिकाओं को स्पष्ट करने, और गुयाना शील्ड से उत्पन्न होने वाले और बाद में अमेरिका भर में विविधीकरण के अपने ऐतिहासिक जैव-भूगोल को पुनर्गठित करने के लिए 349 परमाणु और 76 प्लास्टिड लोकी का उपयोग करके *वैनिला* वंश के लिए एक सुदृढ़ फाइलोगेनोमिक ढांचा स्थापित करता है।
यह शोध पत्र एक स्पेक्ट्रल अस्तित्व मानदंड प्रस्तुत करता है, जिसे असमानता के रूप में व्यक्त किया गया है, ताकि विभिन्न जनसंख्या संरचनाओं में सहयोग के विकास को एकीकृत किया जा सके और यह प्रदर्शित किया जा सके कि कैसे नोवाक के पांच नियम प्राइज़ समीकरण से व्युत्पन्न विशिष्ट स्केलर मामलों के रूप में उभरते हैं।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि जबकि असा गार्ड आर्किया (Asgard archaea) के जीनोम व्यापक प्रोकैरियोटिक-समान क्षैतिज जीन स्थानांतरण (horizontal gene transfer) द्वारा आकार लेते हैं, उनका काफी बड़ा आकार मुख्य रूप से यूकेरियोटिक-समान जीन दोहराव (eukaryotic-like gene duplications) द्वारा संचालित होता है, जो यूकेरियोजेनेसिस (eukaryogenesis) के अंतर्निहित जीनोमिक संक्रमणों के बारे में नई अंतर्दृष्टि प्रदान करता है।
एक बड़े कॉमन-गार्डन प्रयोग से पता चलता है कि *मरक्यूरिएलिस एनुआ* (Mercurialis annua) के द्विलिंगी (dioecious) पौधे में, विस्तार के दौरान चयन ने प्रजनन आश्वासन और सफल स्थापना सुनिश्चित करने के लिए सीमा छोर पर बढ़ी हुई लीकी सेक्स अभिव्यक्ति (leaky sex expression) और प्रजनन प्रयास को अनुकूलित किया है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि ह्यूमन पैराइन्फ्लुएंजा वायरस टाइप 1 (HPIV-1) में V प्रोटीन क्षेत्र ने एक विशिष्ट स्यूडोजीनाइजेशन (pseudogenization) का अनुभव किया है जो स्टॉप कोडन के महत्वपूर्ण अधिशेष द्वारा लक्षित है, जो इस बात की पुष्टि करता है कि आरएनए (RNA) एडिटिंग के नुकसान से इस पूर्वज रीडिंग फ्रेम का कार्यात्मक क्षय हुआ है, न कि ओवरलैपिंग कोडिंग बाधाओं के तहत इसे बनाए रखा गया है।
बैकक्रॉसिंग प्रयोगों के सिंगल-न्यूक्लियस आरएनए सीक्वेंसिंग और होल-जीनोम सीक्वेंसिंग को एकीकृत करके, यह अध्ययन *Artemia* ब्राइन श्रिम्प में लैंगिक से अलैंगिक प्रजनन में परिवर्तन के संभावित आनुवंशिक आधार के रूप में, Z गुणसूत्र पर स्थित एक विशिष्ट 8-मेगाबेस क्षेत्र की पहचान करता है जिसमें दो विभेदक रूप से व्यक्त होने वाले ओोजेनेसिस जीन, *ITPR* और *USP8* शामिल हैं।
273 आधुनिक और 25 प्राचीन जीनोम को अनुक्रमित करके, यह अध्ययन प्रकट करता है कि र्युक्यू जोमोन आबादी मुख्य भूमि जोमोन समूहों से लगभग 6,900 वर्ष पूर्व अलग हुई थी, गंभीर बाधाओं (बॉटलनेक्स) का अनुभव किया था, और बाद में लगभग 1,000 वर्ष पूर्व मुख्य भूमि के प्रवासियों के साथ संकरण किया था, जिससे समकालीन र्युक्यू आबादी की विशिष्ट आनुवंशिक संरचना आकार लेती है।
X-गुणसूत्र विविधता के विश्लेषण में एक गंभीर पद्धतिगत त्रुटि के कारण लेखक द्वारा इस पांडुलिपि को वापस ले लिया गया है, जिससे इसके परिणाम और निष्कर्ष अमान्य हो गए हैं।